授業の主題
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細胞の様々な機能は遺伝子間の相互作用によって生み出される。遺伝子間相互作用は遺伝子制御ネットワークとして記述することができ、その性質を調べるのがシステム生物学の主題の一つである。この授業では遺伝子制御ネットワークとその機能について説明し、生命科学の数理的側面を紹介する。
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学修目標（到達目標）
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授業の前半では遺伝子制御ネットワークの概念と頻出するモチーフについて説明し、複数の遺伝子間の相互作用の結果生まれる細胞機能について解説する。授業の後半では生化学反応の微分方程式の基礎について説明し、生命科学の数理的側面の基礎を理解することを目指す。
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授業概要
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授業は毎回Zoomを使いオンラインで行う。
1回目 ガイダンス、遺伝子発現制御の基礎
2回目 単純制御と負のフィードバックループ1
3回目 単純制御と負のフィードバックループ2
4回目 遺伝子制御ネットワークの正のフィードバックループ
5回目 コヒーレント・インコヒーレントフィードフォワードループ
6回目 生化学反応の基礎とミカエリスメンテン式
7回目 定常状態の安定性
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評価方法と割合
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評価方法
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次項の項目及び割合で総合評価し、次のとおり判定する。
「Ｓ（達成度90％～100％）」、「Ａ（同80％～90％未満）」、
「Ｂ（同70％～80％未満）」、「Ｃ（同60％～70％未満）」を合格とし、
「不可（同60％未満）」を不合格とする。（標準評価方法）
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評価の割合
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授業には３分の２以上の出席を必要とする
小レポート 30%
レポート 70%
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授業時間外の学修に関する指示
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予習に関する指示
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★2．オンデマンド教材（授業内容の一部）
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予習に関する教材
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オンデマンド教材（授業内容の全体）
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復習に関する指示
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★2．オンデマンド教材（授業内容の一部）
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復習に関する教材
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オンデマンド教材（授業内容の全体）
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教科書・参考書
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教科書
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Molecular Biology of the Cell 6th Ed.
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Alberts et al.
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Garland Science
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2014
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参考書
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Introduction to Systems Biology
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Uri Alon
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Chapman & Hall/Crc
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2006
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オフィスアワー等（学生からの質問への対応方法等）
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毎週金曜17:00以降
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履修条件
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特になし
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特記事項
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この授業では微分方程式などの数式を扱う。微分積分や線形代数の知識は授業を履修するのに必須ではないが、理解を深めるために事前に復習しておくことが望ましい。
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