科目名[英文名]
バイオインフォマティクスD[Bioinformatics D]
担当教員[ローマ字表記]
山田 洋一
[
YAMADA, Yoichi
]
科目ナンバー
BIOE3306A
科目ナンバリングとは
時間割番号
45079
科目区分
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講義形態
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開講学域等
理工学域
適正人数
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開講学期
Q4
曜日・時限
金3
単位数
1単位
授業形態
60単位上限
対象学生
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キーワード
「オンデマンド教材型」
講義室情報
自然科学本館(総合研究棟Ⅴ) 105講義室(遠隔(オンデマンド)のみ)
開放科目
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備考
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授業の主題
'本授業では,遺伝子発現データ解析手法について解説する.
授業の目標
'遺伝子発現データ解析にどのようなものがあるのか,そしてそれにより何が明らかになるかを講義する.
授業概要
'1. 遺伝子発現データの正規化
2. 発現変動遺伝子推定
3. KEGGパスウェイ、ジーンオントロジー
4. 遺伝子オントロジーエンリッチメント解析
5. 遺伝子セット解析
6. 遺伝子発現データのクラスタ解析
7. 完全長cDNA,プロモータデータベース、転写因子データベース
8. 期末試験
評価方法と割合
評価方法
'次項の項目及び割合で総合評価し、次のとおり判定する.
「S(達成度90%~100%)」,「A(同80%~90%未満)」,「B(同70%~80%未満)」,「C(同60%~70%未満)」を合格とし,「不可(同60%未満)」を不合格とする. (標準評価方法)
評価の割合
'授業には皆出席することを原則とし,3分の2以上の出席を必要とする.
期末試験 70%
積極性と小テスト 30%
授業時間外の学修に関する指示
予習に関する指示
予習に関する教材
復習に関する指示
'復習:講義後に再度配布資料を用いて復習すること.
復習に関する教材
教科書・参考書
特になし
オフィスアワー等(学生からの質問への対応方法等)
'質問は講義時間の前後や電子メール(yamada-y@se.kanazawa-u.ac.jp)で対応.
履修条件
その他履修上の注意事項や学習上の助言
'ノートパソコンを使用するので,必ず持ってくること.金沢大では,授業1コマあたり3時間の学習時間を仮定しています. 授業・実習の前と後にテキストを読んだり,復習をするなど,少なくとも1.5時間の自主学習をして下さい.
特記事項
特になし
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